Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAF8Q9UPN6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms