Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNRF3Q9ULT6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms