Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms