Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRPC5Q9UL62 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms