Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms