Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP8AP2Q9UKL3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms