Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP21Q9UK80 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms