Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCTN4Q9UJW0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCTN4Q9UJW0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms