Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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