Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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RABGEF1Q9UJ41 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RABGEF1Q9UJ41 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
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RABGEF1Q9UJ41 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RABGEF1Q9UJ41 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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RABGEF1Q9UJ41 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGEF1Q9UJ41 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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RABGEF1Q9UJ41 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGEF1Q9UJ41 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGEF1Q9UJ41 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGEF1Q9UJ41 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGEF1Q9UJ41 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGEF1Q9UJ41 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGEF1Q9UJ41 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGEF1Q9UJ41 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
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