Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS7AQ9UBW8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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