Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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CNTN3Q9P232 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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