Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC41.69■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
CCDC180Q9P1Z9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
CCDC180Q9P1Z9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms