Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms