Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms