Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms