Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms