Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms