Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED9Q9NWA0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms