Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms