Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms