Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms