Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms