Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms