Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms