Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH2B1Q9NRF2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms