Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC31BQ9NQW1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms