Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTA1Q9NP79 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms