Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC2Q9H6S0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms