Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms