Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM12Q9H4Q4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms