Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms