Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXD1Q9GZZ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXD1Q9GZZ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXD1Q9GZZ0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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HOXD1Q9GZZ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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HOXD1Q9GZZ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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HOXD1Q9GZZ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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HOXD1Q9GZZ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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HOXD1Q9GZZ0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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HOXD1Q9GZZ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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HOXD1Q9GZZ0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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HOXD1Q9GZZ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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HOXD1Q9GZZ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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HOXD1Q9GZZ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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