Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms