Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms