Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR12Q9C0I1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms