Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms