Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FOXQ1Q9C009 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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FOXQ1Q9C009 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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FOXQ1Q9C009 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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FOXQ1Q9C009 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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