Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms