Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms