Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDCA4Q9BXL8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms