Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL3Q9BXA9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms