Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms