Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP1Q9BWH6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP1Q9BWH6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms