Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms