Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms