Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms