Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDC1Q9BTX1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms