Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms