Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms